天才発明家･木江田博士（声・槐柳二）が、ついにタイムマシ－ン＝タイムボカンを完成させた。博士自ら試運転を行うが、戻ってきたタイムボカンの中には木江田博士はいなかった。博士の孫娘･淳子（声・岡本茉利）と助手を勤めていた丹平（声・太田淑子）は、どこの時代で消えたか分からない博士を探しに時間の旅に出かける。そのころマージョ（声・小原乃梨子）、グロッキー（声・八奈見乗児）、ワルサー（声・立壁和也）たちは、木江田博士がいるところにダイナモンドの鉱脈があると思い込み、タイムボカンを奪おうとするが失敗。そのかわり研究所から盗んだ知識でグロッキーがタイムガイコッツを完成させ、タイムボカンを追跡し始める。【以上、WARNER VISION JAPANのビデオ宣伝資料より引用】。人気シリーズの第一弾。リピート放送分を含めると全65回。