シリーズ第2作。八神太一たちの冒険から3年後。デジタルワールドに新たな敵・デジモンカイザーが現れる。デジタルワールドの征服と全デジモンの支配を企むカイザーにアグモンたちは立ち向かうが、謎の力で進化を封じられて絶体絶命のピンチに!そんな時、高石タケルは転校先で本宮大輔と出会う。大輔は新たなデジヴァイス「D-3」を受け取り、新たな選ばれし子供へとなる。太一の妹の八神ヒカリとも再会、大輔たちはデジタルワールドへと向かうが…。【以上、東映チャンネル番組広報資料より引用】記載の放送期間は関東地区のもの。大阪地区は、2000/04/09～2001/04/01。【各回サブタイトル】第１回「勇気を受け継ぐ者」、第50回（最終回）「ぼくらのデジタルワールド」。
| キー局 | CX | 放送曜日 | 日 | 放送期間 | 2000/04/02～2001/03/25 |
| 放送時間 | 09:00-09:30 | 放送回数 | 50 回 | 連続/単発 | 連続 |
| 主な出演 | （声の出演：木内レイコ、夏樹 リオ、浦和めぐみ、荒木 春恵、藤田 淑子、風間 勇刀、水谷 優子、前田 愛、菊池 正美、天神 有海、野田 順子、浦和めぐみ、松本 美和、徳光 由香、山崎和佳奈、杉野 博臣（杉野ヒローミ、杉野田ぬき）、遠近 孝一、山本 泰輔、） | ||||
| 主な脚本 | （シリーズ構成：前川 淳、吉村 元希）（脚本：前川 淳、浦沢 義雄、吉村 元希、まさきひろ） | ||||
| 主な演出 | （監督：角銅 博之、梅沢 淳稔、吉沢 孝男）（演出：川田 武範）（演出助手：地岡 公俊） | ||||
| 原作 | （原案・本郷あきよし） | ||||
| 局系列 | FNN | ||||
| 制作会社 | 東映アニメーション、CX | ||||
| 主題歌 | （エンディング：AiM「いつも いつでも」（作詞：松木 悠、作曲：白川 明、編曲：太田美知彦）(26)-(50)） | ||||
| ビデオ | DVD：東映ビデオ | ||||
| 美術 | （原画：長崎 重信） | ||||
