東京のホテルで長崎市内にある観光会社の社長・田沼武雄（伊藤洋三郎）が殺された。田沼は心臓を刺され、そのうえロープで首を吊られ、手に女のものと見られる長い髪を握っていた。さらに遺体の上着には「恨みの首一つ」と書かれた短冊が留められていた。現場に駆けつけた南部平蔵（村上弘明）と南部率いる南平班のメンバーは捜査を開始する。第一発見者であるホテルのフロントマネージャー・山路啓輔（鳥羽潤）から話を聞いていると、ロビーの窓越しにロングコートを着た髪の長い女が見えるのに気づく南部。後を追うがすでに気配すらなかった。南部と高村六郎（鈴木一真）は捜査のため長崎へ。田沼の会社を訪れると、県議会議員・亀山雅樹（小木茂光）と建設会社の社長・山田岳士（江藤潤）が田沼の秘書・片桐はるな（宮本真希）に状況を説明するよう詰め寄っていた。田沼と旧知の仲である二人は、殺されるようなトラブルを田沼が抱えていたとは考えられないと語る。だが、はるなは20年前に田沼が原因で自殺に追い込まれた人物がいたという噂を聞いたことがあると話す。そんな中、山田が殺害された。またも殺害後に首を吊られ、手には女の髪が、そして「恨みの首二つ」と書かれた短冊も発見された。南部は長崎南署の刑事・榎田（佐戸井けん太）の協力で、20年前に鬼塚省三（黒部幸英）というガラス細工職人が田沼と山田、そして亀山に土地を騙し取られて自殺したことを突き止める。鬼塚には二人の娘がいたが、長女の翠（潮美華）は父の後を追うように自殺していた。一人残された次女の瑠璃子（内田未来）は当時8歳で大阪の親類に引き取られていた。一方、東京の現場で田沼が手にしていた頭髪の人物が特定された。２年前にガス爆発で重傷を負った弁護士の岩田瑠璃子だった。瑠璃子は瀕死状態で病院に搬送されたが、翌日何故か病室から姿を消していた。捜査を進めると、鬼塚瑠璃子と岩田瑠璃子が同一人物であることが判明。南部らは父親と姉の復讐を果たすための瑠璃子の犯行と考え、次のターゲットと思われる亀山の周辺で張り込みを行う。しかし翌朝、亀山の秘書・足立裕子（白羽ゆり）の死体が発見される。死体近くには「恨み首三つ」と書かれた短冊が、さらに殺害時刻の現場付近でロングコートを着た髪の長い女が目撃されていた。南部らは岩田瑠璃子の犯行と考えるが、そんなとき岩田瑠璃子が白骨化した状態で発見されたと連絡が入る…。【以上、TBS広報資料より引用】協力：ホテル咲都、エス・ジー・シー佐賀航空、東北新社、NEWIMEGE AUTOCUSTOM、梅月堂、ソニー。ロケ協力：長崎県フィルムコミッション(JFC)、長崎市、NPO法人長崎の風、グラバー園、前田冷菓、カトリック長崎大司教区、長崎緑地公園管理事業協同組合、ハウステンボス、NBC（長崎放送）、庵璃瑠、軍艦島コンシェルジュ、レントシーバー。車輌：マエダオート。【出典：ドラマ本体のクレジット表示より採録（採録：古崎康成）】