TVシリーズの第51話「透明の海アルテミス｣前後編をメインに細かなエピソードを加え再編集したもの。鉄郎、メーテルを乗せた999号はアンドロメダを目指し、果てしない旅を続けていた。数々の出会い、別れ…、追憶にひたっている鉄郎たちの前に、突然中心から光を発する不定形生命体が現れ999号の軌道を阻んだ。車掌からの連絡を受けた鉄道警備隊は波動ミサイルで不定形生命体を排除。しかし、砕かれた無数の生命体は999号めがけて飛んできた。【以上、東映チャンネル広報資料より引用】主題歌は、劇場用映画「銀河鉄道999」と同じ。