戦国時代、１羽の鷲が生まれたばかりの男の赤ん坊をさらっていった。赤ん坊は忍びの里で忍者の子として育ち、フジ丸と名づけられる。当時群雄の間では、天下のゆくえを決める秘密兵器の製法が記された巻物“龍煙の書”をめぐって、激しい争奪戦が繰り広げられていた。争いに巻きこまれた少年忍者フジ丸は、平和を愛する少女ミドリとともに、宿敵・風魔十法斉、伊賀の忍者軍、南蛮邪法の怪人たちと、忍法〝木の葉隠れ〟などを駆使して戦う。【以上、アニメージュ編集部編「TVアニメ25年史」（1988/12/01、徳間書店刊）より引用】東映動画のテレビアニメ第２作。番組の終りに戸隠流三十四代目・初見良昭による忍びの術の解説「忍法千一夜」が３分間ついていた。一部資料では放送終了が1965/08/30と記載されている。放送枠は第32回より火曜19:30～20:00に移行。放送回のうち第７回（1964/07/19放送）、第14回（1964/09/06放送）、第24回（1964/11/15放送）は、それまでの総集編を放送。「生きているヒーローたち 東映TVの30年」（1989年、講談社刊）では、放送終了1964/12/13と記載されている。【役名（声の演技者）】風のフジ丸（小宮山清）、太助・チョロ（芳川和子）、ミドリ・美香（加藤ミドリ）、ポン吉・おせん（伊藤牧子）、チョロ（山本喜代子）、アイレル（中川謙二）、ガバルガ（久富惟晴）、ウィルフ（杉谷頼秀）、八右衛門・マヌエル（内山森彦）、十法斉（湯淺実）。【参考文献：「テレビ朝日社史ファミリー視聴の25年」（1984/02/01テレビ朝日刊）、アニメージュ編集部編「TVアニメ25年史」（1988/12/01、徳間書店刊）】
| キー局 | NET | 放送曜日 | 日 | 放送期間 | 1964/06/07～1965/08/31 |
| 放送時間 | 18:30-19:00 | 放送回数 | 65 回 | 連続/単発 | 連続 |
| 主な出演 | 本間千代子、初見 良昭、（声の出演：小宮山 清、芳川 和子、加藤ミドリ（加藤みどり）、伊藤 牧子、山本喜代子（山本 嘉子、山本嘉代子）、中川 謙二、久富 惟晴、杉谷 頼秀（杉谷 頼彦）、内山 森彦、立川 勝利、水野旗之介、植田 襄（植田 譲）、みきさちこ、剣持 伴紀、湯淺 実（湯浅 実）、劇団三十人会）（語り手：湯淺 実（湯浅 実）） | ||||
| 主な脚本 | 飯島 敬、志原 弘、内田 弘三、白川 大作、吉野 次郎、谷井 敬、田中 実、加藤 精二 | ||||
| 主な演出 | 白川 大作、矢吹 公郎、田宮 武、勝間田具治、村山 鎮雄、白根 徳重、真野 好央、竹田 満 | ||||
| 原作 | 白土 三平（「ぼくら」連載）、（原案：木谷 梨男、福原 宗司） | ||||
| 局系列 | ANN | ||||
| 制作会社 | （制作：東映動画） | ||||
| 企画 | 飯島 敬(1)-(28)、小野澤 寛（小野沢 寬）(1)-(65)、斉藤 侑(29)-(65)、宮崎 慎一(29)-(65) | ||||
| 音楽 | 服部 公一、（録音：神原 広巳） | ||||
| 主題歌 | （エンディングテーマ：（前期）鹿内タカシ（鹿内 孝）、西六郷少年合唱団「少年忍者風のフジ丸」（作詞：小川 敬一、作曲：服部 公一）（朝日ソノラマ）、（後期）西六郷少年合唱団「戦う少年忍者」（作詞：小川 敬一、作曲：服部 公一）（朝日ソノラマ）） | ||||
| 撮影技術 | 吉村 次郎、高橋 宏固、（編集：鈴木 亮） | ||||
| 美術 | 浦田 又治、（原画：小田部羊一、生野 徹太、中谷 恭子（山下 恭子）、薄田 嘉信、堰合 昇、阿部 隆、黒沢 隆夫、宮崎 駿、大塚 康生）（作画監督：楠部大吉郎、大工原 章、小田部羊一）（背景：山崎 誠、秦 秀信、伊藤 英治） | ||||
