あの風変わりな刑事・糸村聡が帰ってきた！舞台は京都へ、新チーム始動！事件現場に残された遺留品に秘められた「声」を読み取る糸村…ラストで明かされる三分の真実とは!?神戸港を周遊する遊覧船が爆破され、乗員乗客が人質になる事件が発生。身代金２億円が運航会社の黒沢興産に要求され、京都府警・特別捜査対策室、通称“特対"が動き出した。メンバーの神崎莉緒（栗山千明）も、現場へと急行する。一方で、休暇中の刑事・糸村聡（上川隆也）が、偶然にもその船に乗り合わせていた。糸村はその爆発現場で燃えかけの和紙を拾う…。人質の解放後、糸村は莉緒に遺留品の鑑定を依頼するのだが…!?まもなく事件の指揮を任された特対の室長・桧山亘（段田安則）は、遊覧船に乗っていた議員・長部麗子（財前直見）と黒沢興産の間に、知られざる繋がりがあるのではと睨む。特対刑事の佐倉路花（戸田恵子）や雨宮宏（永井大）らが、彼女らの周辺を探り出すことに。一方の糸村は、例によって遺留品の和紙のことばかりを調べている始末だったが、その線で辿りついた人物が、なんと黒沢興産の創業者である黒沢恒之助（伊東四朗）で…!?【以上、テレビ朝日広報資料より引用】